產(chǎn)品說明書
FAQ
COA
已發(fā)表文獻
產(chǎn)品描述
Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit 是基于Hieff Clone® 快速克隆技術(shù)的定點突變系統(tǒng)。使用本試劑盒，可一次性向目標質(zhì)粒上三至五個不連續(xù)位點（相距超過50bp）同時引入定點突變。該試劑盒由兩個模塊組成：Hieff® II Pfu DNA Polymerase擴增模塊和Hieff Clone® 快速克隆模塊。Hieff® II Pfu DNA Polymerase超高的保真度顯著降低了擴增過程中引入新突變的可能性，其卓越的長片段擴增能力，廣泛適用于長度小于20 kb的任何質(zhì)粒擴增。Hieff Clone®快速克隆系統(tǒng)利用高效的同源重組反應替代傳統(tǒng)的退火成環(huán)反應。因此使用Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit進行DNA定點突變時，引物設(shè)計更加靈活，且擴增反應以指數(shù)方式進行，極大減少了模板使用量，有利于原始甲基化模板的徹底降解。
Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit中的重組酶Exnase MultiS經(jīng)過優(yōu)化，專門針對多堿基進行定點突變。此外，如擴增產(chǎn)物特異，其DpnI消化產(chǎn)物可不進行DNA純化而直接用于重組反應。高度優(yōu)化的反應緩沖液、快捷的操作流程以及極高的成功率，使得Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit成為DNA多點突變試劑盒。
應用范圍
DNA定點突變
注：如使用本品對質(zhì)粒進行定點突變，請使用甲基化酶無缺陷的宿主菌 (例如Top10、DH5α、JM109)擴增原始質(zhì)粒！
產(chǎn)品組成
|
編號 |
組分 |
產(chǎn)品編號/規(guī)格 |
|
11004ES10 （10 T） |
||
|
11004-A |
2×Hieff® II PCR buffer |
1.25 mL |
|
11004-B |
dNTP Mix (10 mM each) |
50 μL |
|
11004-C |
Hieff® II Pfu DNA Polymerase (1 U/μL) |
50 μL |
|
11004-D |
Dpn I (10 U/μL) |
50 μL |
|
11004-E |
2× Hieff Clone® MultiS Enzyme Premix |
100 μL |
運輸與保存方法
冰袋（wet ice）運輸。產(chǎn)品-20℃保存。有效期1年。
不連續(xù)多堿基（相距超過50bp）定點突變實驗流程（以不連續(xù)三堿基為例）
實驗流程概覽（圖一）
圖一：使用Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit進行不連續(xù)三堿基定點突變實驗流程
1. 引物設(shè)計
向質(zhì)粒三個不連續(xù)位點引入定點突變，只需設(shè)計三對引物將質(zhì)粒分段擴增即可。引物設(shè)計基本原則為：在每個待突變位點處設(shè)計部分反向互補的擴增引物對。每對正反向引物5’端包含15-21 bp反向互補區(qū)域（GC含量40%-60%為佳），各引物待突變位點至引物3’端區(qū)域Tm值高于60℃為佳。所需引入突變可以包含在互補區(qū)域內(nèi) (需要兩條引物上均引入點突變)，也可以包含在任一條引物的非互補區(qū)域 (只需在一條引物上引入點突變)，請勿將突變位點置于引物末端。以向pUC18引入三堿基突變?yōu)槔镌O(shè)計具體方案如圖二所示。
圖二：向質(zhì)粒引入不連續(xù)多堿基定點突變引物設(shè)計示意圖
注：待突變位點B、C處的正反向擴增引物設(shè)計方式與位點A 處的引物設(shè)計方式一致。計算引物Tm值時，應計算待突變位點至引物3’端這一區(qū)域內(nèi)的堿基，待突變位點至引物5’端區(qū)域內(nèi)的堿基不應參與計算。
2. 目標質(zhì)粒分段擴增
以待突變位點A、B、C為界，將質(zhì)粒分為AB、BC段和CA段。使用Hieff® II Pfu DNA Polymerase對各段分別進行擴增。AB段擴增引物對為：待突變位點A正向擴增引物和待突變位點B反向擴增引物；BC段擴增引物對為：待突變位點B正向擴增引物和待突變位點C反向擴增引物；CA段擴增引物對為：待突變位點C正向擴增引物和待突變位點A反向擴增引物。
2.1 配制PCR反應體系
反應各組分解凍后請充分搖勻，使用完畢后及時放回-20℃。2×Hieff® II PCR buffer請勿長時間敞口放置。
為了增加擴增特異性，反應體系配制過程請于冰水浴中進行。為了防止Hieff® II Pfu DNA Polymerase的校對活性降解引物，請將聚合酶最后加入反應體系中。
推薦反應體系如下：
|
ddH2O |
Up to 50 μL |
|
2×Hieff® II PCR buffer |
25 μL |
|
dNTP Mix (10 mM each) a |
1 μL |
|
模板DNA b |
Optional |
|
引物1 (10 μM) |
2 μL |
|
引物2 (10 μM) |
2 μL |
|
Hieff® II Pfu DNA Polymerase (1 U/μL) c |
1 μL |
a. 請勿使用dUTP和帶有尿嘧啶的引物或模板。
b 在各片段能正常擴增的前提下，應盡量減少質(zhì)粒模板使用量，推薦≤1 ng。待擴增質(zhì)粒長期放置、反復凍融會導致模板質(zhì)粒斷裂、開環(huán)或降解，因此推薦使用新鮮制備的質(zhì)粒作為模板。
c. 推薦的酶的終濃度為1 U/50 μl反應?？蓪ieff® II Pfu DNA Polymerase在0.5-2 U/50 μl之間進行優(yōu)化，但不要超過2 U/50 μl，尤其當擴增子長度大于5 kb時。
2.2 PCR擴增反應
推薦PCR反應條件：
|
循環(huán)步驟 |
溫度 |
時間 |
循環(huán)數(shù) |
|
預變性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
|
變性a 退火b 延伸c |
95℃ 60℃～72℃ 72℃ |
15 sec 15 sec 30-60 sec/kb |
30 d |
|
徹底延伸 |
72℃ |
5 min |
1 |
a. 對于大多數(shù)質(zhì)粒，變性溫度使用95℃即可。
b. Hieff® II Pfu DNA Polymerase能夠促進模板和引物高效退火。一般來說，退火溫度設(shè)置為引物Tm值即可。如果需要，可以建立一個溫度梯度反應去尋找引物模板結(jié)合的最適溫度。退火時間太長可能導致擴增產(chǎn)物在膠上呈現(xiàn)彌散狀。
c. 對于大多數(shù)擴增反應，延伸過程可在72℃進行。長的延伸時間有助于提高擴增產(chǎn)量。
d. 為了防止擴增過程中引入非目標突變，強烈建議擴增循環(huán)數(shù)≤35。如果擴增效率良好的話，推薦擴增循環(huán)數(shù)應≤30。
反應結(jié)束后取少量擴增產(chǎn)物進行瓊脂糖電泳檢測。如目標質(zhì)粒正確擴增，則可進行下步實驗。
3. 擴增產(chǎn)物DpnI消化，去除甲基化模板質(zhì)粒
因上述擴增產(chǎn)物中包含原始模板質(zhì)粒，為防止其在轉(zhuǎn)化后形成假陽性轉(zhuǎn)化子，必須在進行重組環(huán)化之前進行DpnI消化。
推薦反應體系如下：
|
DpnI |
1 μL |
|
擴增產(chǎn)物 |
40～50 μL |
將上述反應體系置于37℃恒溫反應1～2小時。如產(chǎn)物擴增特異，產(chǎn)物條帶單一，DpnI消化產(chǎn)物無需純化，可直接用于后續(xù)重組反應。如擴增不特異，DpnI消化結(jié)束后應膠回收純化目標擴增產(chǎn)物。
4. 重組反應
4.1 配制重組反應體系
質(zhì)粒AB、BC和CA段擴增產(chǎn)物末端分別包含相對應的完全一致的一段序列，因此在Exnase MultiS催化下三擴增產(chǎn)物末端可以發(fā)生同源重組，完成擴增產(chǎn)物環(huán)化過程。于冰水浴中，將下列組分依次加到無菌的1.5 ml Eppendorf管或PCR管的管底。如果不慎將液體粘在管壁，請務(wù)必通過短暫離心使其沉入管底。體系配制完成后，用移液器上下輕輕吹打幾次混勻各組分，避免產(chǎn)生氣泡 (請勿劇烈震蕩或者渦旋混勻)。
|
ddH2O |
Up to 20 μL |
|
AB段DpnI消化產(chǎn)物 |
x ng |
|
BC段DpnI消化產(chǎn)物 |
x ng |
|
CA段DpnI消化產(chǎn)物 |
x ng |
|
2× Hieff Clone® MultiS Enzyme Premix |
10 μL |
Exnase MultiS多點突變重組反應體系最適DNA使用量為每片段0.03 pmol。該摩爾數(shù)對應的DNA質(zhì)量可由以下公式粗略計算獲得：
DpnI消化產(chǎn)物最適使用量 = [0.02 × 目標質(zhì)粒堿基對數(shù)] ng (0.03 pmol)
例如，AB段長度為1 kb，BC段長度為2 kb，CA段長度為5 kb。則DpnI消化產(chǎn)物最適使用量為：AB段0.02 × 1000 = 20 ng；BC段0.02 × 2000 = 40 ng；CA段0.02 ×5000 = 100 ng。
注：DNA量太多或者太少都將降低環(huán)化效率。常用的吸光度測量法極易受DNA純度、DNA稀釋液pH等因素影響，測定值和DNA實際濃度往往偏差較大。因此，請務(wù)必通過瓊脂糖電泳預先確認DNA濃度，盡量嚴格按照推薦量配制反應體系。當DpnI消化產(chǎn)物最適使用量計算值不足10 ng或者超過200 ng時，加入10ng或200 ng即可。DpnI消化產(chǎn)物不純化直接用于重組反應時，使用量不應超過反應總體積的1/5，即4μl。
4.2 重組反應
1）將上述體系置于50℃反應 20-50 min。
2）待反應完成后，立即將反應管置于冰水浴中冷卻5 min。
3）之后，反應產(chǎn)物可直接進行轉(zhuǎn)化；也可儲存于-20℃，待需要時解凍轉(zhuǎn)化。
5. 反應產(chǎn)物轉(zhuǎn)化、涂板、克隆鑒定
1）取10 μl冷卻反應液，加入到100 μl感受態(tài)細胞中，輕彈管壁數(shù)下混勻，在冰上放置30 min。
2）42℃熱激45～90秒，冰水浴孵育2 min。
3）加入900 μl SOC或LB培養(yǎng)基，37℃孵育10min充分復蘇。
4）37℃搖菌45 min。
5）取100 μl菌液均勻涂布在含有適當抗生素的平板上。將平板倒置，于37℃過夜培養(yǎng)。
注：我們推薦您使用轉(zhuǎn)化效率>108 cfu/μg的感受態(tài)細胞。如果感受態(tài)轉(zhuǎn)化效率<108 cfu/μg (例如用CaCl2法新鮮制備的感受態(tài)轉(zhuǎn)化效率通常在106-107 cfu/μg之間)，請將培養(yǎng)菌液在5,000 rpm離心3 min收集菌體，用100 μl LB培養(yǎng)基重懸后全部涂板。
注意事項
1）引物設(shè)計時5’端反向互補區(qū)盡量選擇無重復序列，且GC含量比較均勻的區(qū)域。當這一區(qū)域內(nèi)GC含量在40%～60%范圍之內(nèi)時，重組環(huán)化效率將達到最大。如這部分區(qū)域GC含量高于70%或者低于30%，重組環(huán)化效率會受到較大影響。
2）當兩突變位點相距小于50bp時，應將其視為一個突變位點，將兩突變引入同一條/對引物進行實驗。
3）DpnI只能識別甲基化DNA，請務(wù)必使用從甲基化酶無缺陷的宿主菌中擴增的質(zhì)粒作為PCR模板。
4）質(zhì)粒PCR擴增結(jié)果需高度特異，雜帶較多會影響實驗結(jié)果。
5）重組反應體系中應盡量避免金屬絡(luò)合劑(如EDTA)的帶入。因此，建議將DNA純化產(chǎn)物溶解在pH8.0的ddH2O中保存(常規(guī)膠回收試劑盒中的洗脫液可用pH8.0的ddH2O替代)，請勿使用TE進行DNA保存。
6）冷卻后的反應產(chǎn)物應在1h內(nèi)進行轉(zhuǎn)化，且轉(zhuǎn)化前保持在冰水浴中。如需儲存，于-20℃凍存。盡量避免室溫較長時間放置或4℃長期儲存。
7）反應產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化體積不應超過感受態(tài)細胞體積的1/10，否則會降低轉(zhuǎn)化效率。另外，當轉(zhuǎn)化的DNA濃度太高時，會抑制轉(zhuǎn)化反應。將重組反應產(chǎn)物稀釋5倍后取1/5進行轉(zhuǎn)化。
8）為了您的安全和健康，請穿實驗服并戴一次性手套操作。
9）本產(chǎn)品僅作科研用途！
相關(guān)產(chǎn)品
|
產(chǎn)品名稱 |
貨號 |
規(guī)格 |
|
10135ES60/76/80 |
100/500/1000 U |
|
|
10136ES03/08/25 |
1/5/25 mL |
|
|
10911ES20 |
20 T |
|
|
10912ES10 |
10 T |
|
|
11003ES10 |
10 T |
HB211209
