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            Hieff Clone? Plus Multi One Step Cloning Kit

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            產(chǎn)品說明書

            FAQ

            COA

            已發(fā)表文獻(xiàn)

            新升級(jí)產(chǎn)品10923ES重磅來(lái)襲!

            更強(qiáng)的連接效率+更省的試劑量!一起點(diǎn)擊下方圖片查看新產(chǎn)品吧~~~

             

            Hieff Clone® Plus Multi One Step Cloning Kit是一款簡(jiǎn)便、快速、高效的DNA定向克隆產(chǎn)品,該試劑盒可以將PCR產(chǎn)物定向克隆至任何載體的任何位點(diǎn),可高效克隆50 bp-10 kb片段。將載體線性化,并在插入片段正、反向PCR引物5’端引入15-25 bp的線性化載體末端同源序列,使得插入片段PCR產(chǎn)物5’和3’末端分別帶有與線性化載體兩末端對(duì)應(yīng)的完全一致的序列。PCR產(chǎn)物和線性化載體在重組酶的作用下,僅需50℃反應(yīng)20 min即可進(jìn)行轉(zhuǎn)化,完成定向克隆??寺£?yáng)性率可達(dá)95%以上。

            試劑盒中2×Hieff Clone® MultiS Enzyme Premix預(yù)混了重組酶和重組反應(yīng)所需緩沖液,并添加了獨(dú)特的重組增強(qiáng)因子,可顯著提高重組克隆效率。使用該試劑盒,可以一次實(shí)現(xiàn)多至5個(gè)片段的順序拼接克隆。

             

            產(chǎn)品組分

            組分編號(hào)

            組分名稱

            10912ES08

            10912ES10

            10912-A

            2× Hieff Clone® MultiS Enzyme Premix

            50 μL

            100 μL

            10912-B

            500 bp Control Insert (25 ng/μL)

            5 μL

            5 μL

            10912-C

            pUC 19 Control Vector, linearized (50 ng/μL)

            5 μL

            5 μL

             

            產(chǎn)品應(yīng)用

            快速克??;定向克隆;定點(diǎn)突變。

             

            儲(chǔ)存條件

            冰袋運(yùn)輸。-25~-15℃保存,有效期1年。

             

            注意事項(xiàng)

            1.為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并佩戴一次性手套操作。

            2.本產(chǎn)品僅作科研用途!

             

            使用說明

            1 Hieff Clone®多片段一步法快速克隆試劑盒實(shí)驗(yàn)流程圖。

            ①載體線性化:酶切或反向PCR制備線性化載體。

            ②插入片段的制備:由PCR制備,所用擴(kuò)增引物在設(shè)計(jì)時(shí)需在其5’端添加同源序列(圖中以紅色、黃色、紫色和綠色標(biāo)記),使得擴(kuò)增產(chǎn)物之間以及擴(kuò)增產(chǎn)物與線性化載體之間各有一段同源序列。

            1. 制備線性化載體

            選擇合適的克隆位點(diǎn),并對(duì)載體進(jìn)行線性化。建議盡量選擇無(wú)重復(fù)序列且GC含量均勻的區(qū)域進(jìn)行克隆。載體克隆位點(diǎn)上下游25 bp區(qū)域內(nèi)GC含量均在40%-60%范圍內(nèi)最佳。線性化載體可通過限制性內(nèi)切酶酶切或反向PCR擴(kuò)增獲得。

            1)酶切制備線性化載體

            a. 雙酶切線性化:線性化完全,轉(zhuǎn)化背景低。建議使用。

            b. 單酶切線性化:線性化程度較差??蛇m當(dāng)延長(zhǎng)酶切時(shí)間以降低轉(zhuǎn)化背景。

            【注】:不含插入片段的假陽(yáng)性克隆是由未線性化環(huán)狀載體轉(zhuǎn)化而形成的。若這種假陽(yáng)性克隆比例較高,建議重新制備線性化載體。

            2)反向PCR擴(kuò)增制備線性化載體

            建議使用高保真聚合酶(如:2×Hieff Canace® Plus PCR Master Mix(With Dye),Cat#10154ES)進(jìn)行載體擴(kuò)增,以減少擴(kuò)增突變的引入。PCR擴(kuò)增模板應(yīng)盡量使用預(yù)線性化質(zhì)粒,以防止殘留環(huán)狀質(zhì)粒模板對(duì)克隆陽(yáng)性率的影響。

            Hieff Clone®重組反應(yīng)體系兼容幾乎所有酶切反應(yīng)體系和常規(guī)PCR反應(yīng)體系,當(dāng)載體酶切產(chǎn)物或反向PCR擴(kuò)增產(chǎn)物純度較高時(shí),可以無(wú)需純化,直接進(jìn)行重組反應(yīng)。但純度較低且有可能含有未線性化環(huán)狀質(zhì)粒時(shí),建議使用高質(zhì)量的試劑盒對(duì)線性化載體進(jìn)行膠回收純化,以提高產(chǎn)物純度并去除一部分未線性化的環(huán)狀載體,有利于提高重組效率。

            2. PCR擴(kuò)增制備插入片段

            1)設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物

            Hieff Clone®引物設(shè)計(jì)方式:通過在插入片段正、反向PCR引物的5’端引入15-25 bp(不包括酶切位點(diǎn))的線性化載體末端同源序列,使得插入片段PCR產(chǎn)物5’和3’末端分別帶有與線性化載體兩末端對(duì)應(yīng)的完全一致的序列。

            推薦使用翌圣無(wú)縫克隆引物設(shè)計(jì)軟件,自動(dòng)生成插入片段的擴(kuò)增引物。若手動(dòng)設(shè)計(jì),可參照以下實(shí)例。以在pUC18載體(注:與該試劑盒中提供的C組分不同,C組分為pUC19)的EcoR I 和Hind III 酶切位點(diǎn)間插入三段基因的引物設(shè)計(jì)為例,引物具體設(shè)計(jì)方案如下:

            首先設(shè)計(jì)第一片段的正向擴(kuò)增引物和第三片段的反向擴(kuò)增引物(與載體相鄰的兩個(gè)插入片段)。

            第一片段正向擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)方式:

            5’—上游載體末端同源序列+酶切位點(diǎn)(可保留或刪除)+第一片段基因特異性正向擴(kuò)增序列—3’

            第三片段反向擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)方式:

            3’—第三片段基因特異性反向擴(kuò)增序列+酶切位點(diǎn)(可保留或刪除)+下游載體末端同源序列—5’

            【注】:

            ①基因特異性正/反向擴(kuò)增序列即常規(guī)插入片段正/反向擴(kuò)增引物序列;

            ②上游/下游載體末端同源序列為線性化載體最末端序列(用于同源重組),GC含量40%-60%為佳。

             

            2 與載體相鄰的兩個(gè)插入片段引物設(shè)計(jì)方案

            其次設(shè)計(jì)第一片段的反向擴(kuò)增引物和第二片段的正向擴(kuò)增引物。用于片段之間進(jìn)行重組的同源序列可以添加至前方片段的反向擴(kuò)增引物中,也可以添加至后方片段的正向擴(kuò)增引物中,還可以兩片段各添加一部分。以將同源序列添加至前方片段(第一片段)的反向擴(kuò)增引物中為例,引物具體設(shè)計(jì)方案如圖3所示:

            第一片段反向擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)方式:

            3’—第一片段基因特異性反向擴(kuò)增序列+第二片段5’端同源序列—5’

            第二片段正向擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)方式:

            5’—第二片段基因特異性正向擴(kuò)增序列—3’

            【注】:

            ①基因特異性正/反向擴(kuò)增序列即常規(guī)插入片段正/反向擴(kuò)增引物序列;

            ②第二片段5’端同源序列即用于第一片段與第二片段進(jìn)行重組的添加序列。

            最后設(shè)計(jì)第二片段的反向擴(kuò)增引物和第三片段的正向擴(kuò)增引物。設(shè)計(jì)方式與第一片段的反向擴(kuò)增引物和第二片段的正向擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)方式一致。具體方案參見圖3。

            3 第一片段的反向擴(kuò)增引物和第二片段的正向擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)方案

            【注】:最終引物長(zhǎng)度超過40 bp,建議選用PAGE純化方式進(jìn)行引物合成。計(jì)算擴(kuò)增引物退火溫度時(shí),只需計(jì)算基因特異性擴(kuò)增序列的Tm值,載體末端同源序列不應(yīng)參與計(jì)算,為了得到高效率克隆,建議Tm≥48℃。

            2)插入片段PCR擴(kuò)增

            插入片段擴(kuò)增可用任意PCR酶擴(kuò)增,無(wú)需考慮產(chǎn)物末端有無(wú)A尾(重組過程中將被去除,在最終載體中不會(huì)出現(xiàn))。但為了減少擴(kuò)增突變的引入,建議使用高保真聚合酶進(jìn)行擴(kuò)增(如:2×Hieff Canace® Plus PCR Master Mix(With Dye),Cat#10154ES)。

            PCR擴(kuò)增結(jié)束后,取少量產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳以檢驗(yàn)擴(kuò)增產(chǎn)量和特異性。Hieff Clone®重組反應(yīng)體系兼容常規(guī)PCR反應(yīng)體系。因此,如果擴(kuò)增模板不是與載體抗性相同的環(huán)狀質(zhì)粒,且PCR產(chǎn)物電泳條帶單一,則擴(kuò)增產(chǎn)物可以無(wú)需純化,直接用于重組反應(yīng)。但PCR擴(kuò)增產(chǎn)物純度較低時(shí),建議使用高質(zhì)量的試劑盒對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行膠回收純化,以提高產(chǎn)物純度,有利于提高重組效率。

            3. 線性化載體與插入片段濃度測(cè)定

            推薦使用瓊脂糖凝膠電泳比較條帶亮度的方法對(duì)DNA進(jìn)行定量。將線性化載體和插入片段擴(kuò)增產(chǎn)物做數(shù)個(gè)等體積稀釋梯度,原始產(chǎn)物和稀釋后產(chǎn)物各取1 μL進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,與DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)(DNA Marker)比較條帶亮度以確定其近似濃度。

            4.重組反應(yīng)

            1)線性化載體與插入片段使用量計(jì)算

            Hieff Clone® Plus Multi重組反應(yīng)體系最適DNA使用量為每片段(包括線性化載體)0.03 pmoL。該摩爾數(shù)對(duì)應(yīng)的DNA質(zhì)量可由以下公式粗略計(jì)算獲得:

            每片段最適使用量= [0.02×載體堿基對(duì)數(shù)]ng (0.03 pmoL)

            例如,將長(zhǎng)度為0.5 kb、1 kb、2 kb三插入片段克隆至長(zhǎng)度為5 kb的載體時(shí),各片段最適使用量應(yīng)為:

            線性化載體最適使用量:0.02 × 5000 = 100 ng;

            0.5kb插入片段最適使用量應(yīng)為:0.02 × 500 = 10 ng;

            1 kb插入片段最適使用量應(yīng)為:0.02 × 1,000 = 20 ng;

            2 kb插入片段最適使用量應(yīng)為:0.02 × 2,000 = 40 ng。

            【注】:

            1)插入片段DNA使用量應(yīng)大于10 ng。當(dāng)使用上述公式計(jì)算DNA最適使用量低于這個(gè)值時(shí),直接使用10 ng即可。

            2)線性化載體的使用量應(yīng)在50-200 ng之間。當(dāng)使用上述公式計(jì)算最適使用量超出這個(gè)范圍時(shí),則選擇最低或最高使用量即可。

            3)線性化載體和插入片段擴(kuò)增產(chǎn)物未純化,直接使用時(shí),使用總體積應(yīng)不超過反應(yīng)體系體積的1/5,如20 μL體系不超過4 μL。

            2)反應(yīng)體系(推薦冰上配制,各組分使用前需混勻)

            組分

            重組反應(yīng)

            陰性對(duì)照-1

            陰性對(duì)照-2

            陽(yáng)性對(duì)照

            ddH2O

            Up to 20 μL

            Up to 20 μL

            Up to 20 μL

            Up to 20 μL

            2× Hieff Clone® MultiS Enzyme Premix

            10 μL

            0 μL

            0 μL

            10 μL

            線性化載體

            X μL

            X μL

            0 μL

            1 μL

            N個(gè)插入片段

            Y μL

            0 μL

            Y μL

            1 μL

            1 反應(yīng)體系

            【注】:

            1)X和Y分別是根據(jù)公式計(jì)算得到線性化載體和插入片段用量。

            2)陰性對(duì)照-1可用來(lái)確認(rèn)線性化載體有無(wú)環(huán)狀質(zhì)粒殘留,可選擇性進(jìn)行。

            3)當(dāng)插入片段擴(kuò)增模板是與載體抗性相同的環(huán)狀質(zhì)粒時(shí),可用陰性對(duì)照-2來(lái)確認(rèn)有無(wú)環(huán)狀質(zhì)粒模板殘留,可選擇性進(jìn)行。

            4)試劑盒中提供陽(yáng)性對(duì)照反應(yīng)所需組分(B組分和C組分),可用來(lái)排除其他實(shí)驗(yàn)材料及操作因素的影響,可選擇性進(jìn)行。

            3)重組反應(yīng)

            a. 體系配制完成后,用移液器輕輕吸打混勻各組分,短暫離心將反應(yīng)液收集至管底。

            b. 置于50℃反應(yīng)20 -50 min。當(dāng)插入片段總和>5 kb時(shí),建議提高孵育時(shí)間到30-50 min可以增大重組效率。

            【注】:建議在PCR儀或水浴鍋等溫控精確的儀器上進(jìn)行反應(yīng)。

            c. 待反應(yīng)完成后,建議將反應(yīng)管置于冰上冷卻5 min,以防溫度過高降低感受態(tài)轉(zhuǎn)化效率。

            d. 反應(yīng)產(chǎn)物可直接進(jìn)行轉(zhuǎn)化,也可儲(chǔ)存于-20℃,待需要時(shí)解凍轉(zhuǎn)化。

            5.重組產(chǎn)物轉(zhuǎn)化、涂板

            1)在冰上解凍克隆感受態(tài)細(xì)胞(如:DH5α Chemically Competent Cell,Cat#11802ES)。

            2)取10 μL冷卻重組產(chǎn)物,加入到100 μL感受態(tài)細(xì)胞中,輕彈管壁數(shù)下混勻,在冰上放置30 min。

            3)42℃熱激90 sec,冰浴孵育2 min。

            4)加入900 μL SOC或LB培養(yǎng)基,37℃孵育10 min充分復(fù)蘇。37℃,200 rpm,搖菌45 min。

            5)5,000 rpm離心3 min,棄掉900 μL上清。用剩余培養(yǎng)基將菌體重懸,用無(wú)菌涂布棒在含有正確抗性的平板上輕輕涂勻。待菌液被吸收,將平板倒置,于37℃過夜培養(yǎng)。

            6.克隆鑒定

            最方便快捷的方法是菌落PCR。用無(wú)菌的槍頭或牙簽將單個(gè)菌落挑至20-50 μL LB培養(yǎng)基中混勻,直接取1 μL作為PCR模板。推薦至少用一條通用測(cè)序引物進(jìn)行菌落PCR,這樣可以避免PCR假陽(yáng)性的產(chǎn)生。后續(xù)也可做酶切或測(cè)序鑒定。

             

            應(yīng)用實(shí)例

            4 Hieff Clone® Plus Multi One Step Cloning Kit進(jìn)行三片段克隆。

            A:重組轉(zhuǎn)化平板。B:插入片段和載體濃度檢測(cè)電泳圖。C:PCR方法鑒定每個(gè)單片段和最終連接基因。箭頭指示目的條帶。載體:pCAMIBA1302,10 kb,三個(gè)插入片段長(zhǎng)度:1 kb,1.5 kb和2.5 kb,重組反應(yīng)條件:50℃,20 min。

             

             

            400-6111-883