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            Plant Tissue Direct PCR Kit (With Dye) 植物組織直接PCR試劑盒

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            產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)

            FAQ

            COA

            已發(fā)表文獻(xiàn)

            產(chǎn)品簡(jiǎn)介

             

            Plant Tissue Direct PCR Kit (With Dye)植物組織直接PCR試劑盒是一款可直接對(duì)不同類型植物葉片進(jìn)行PCR擴(kuò)增的試劑盒,適應(yīng)性廣、穩(wěn)定性強(qiáng)。試劑盒采用獨(dú)特的裂解緩沖液體系,可以快速的裂解多種植物樣品并釋放出基因組DNA,不需要除去蛋白、RNA或次生代謝產(chǎn)物等,即可將釋放出的基因組DNA作為模板直接用于PCR反應(yīng)。此外,樣品使用量少,低至1 mm植物葉片即可進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。

            本試劑盒中提供的2× Plant Master Mix具有很強(qiáng)的擴(kuò)增兼容性,能直接以待測(cè)樣品裂解液為模板,進(jìn)行高效特異性擴(kuò)增。該試劑為2倍濃縮PCR反應(yīng)混合液,包含了用于PCR擴(kuò)增除模板和引物外的所有組分,大大簡(jiǎn)化操作過(guò)程,降低污染幾率。且含有示蹤染料,PCR產(chǎn)物可直接電泳。

            該試劑盒可用于轉(zhuǎn)基因植株鑒定植物基因分型等。

             

            產(chǎn)品信息

             

            貨號(hào)

            10187ES05 / 10187ES50 / 10187ES70

            規(guī)格

            5 T / 50 T / 200 T

             

            組分信息

             

            組分編號(hào)

            組分名稱

            10187ES05

            10187ES50

            10187ES70

            儲(chǔ)存條件

            10187-A

            Buffer P1

            250 μL

            1.25 mL × 2

            5 mL × 2

            2-8℃

            10187-B

            Buffer P2

            50 μL

            500 μL

            1 mL × 2

            2-8

            10187-C

            2 × Plant Master Mix*

            50 μL

            500 μL

            1 mL × 2

            -25~-15℃

            *2× Plant Master Mix:包含熱啟動(dòng)Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、MgCl2、反應(yīng)緩沖液、PCR反應(yīng)增強(qiáng)劑、優(yōu)化劑以及穩(wěn)定劑等,同時(shí)包含電泳Loading Buffer,PCR完成之后可直接電泳。

             

            儲(chǔ)存條件

             

            1. 試劑10187-A【Buffer P1】,置于2-8℃保存。有效期1年。

            2. 試劑10187-B【Buffer P2】,中和裂解產(chǎn)物,利于更長(zhǎng)時(shí)間保存樣本,置于2-8℃保存。有效期1年。

            3. 試劑10187-C【2 × Plant Master Mix】,-25~-15℃保存,避免反復(fù)凍融。有效期1年。

            試劑盒有效期1年。

             

            使用說(shuō)明

             

            1.植物葉片

            1)研磨裂解法:

            a. 研磨儀破碎:將直徑5 mm左右的葉片置于50 μL Buffer P1中,用研磨儀加鋼珠(鋼珠直徑3 mm左右,共2個(gè))破碎葉片(45 Hz,1 min),葉片破碎后溶液呈現(xiàn)綠色,瞬時(shí)離心,上清液請(qǐng)放在4℃?zhèn)溆?,? μL用于PCR擴(kuò)增。

            b. 槍頭搗碎:推薦使用幼嫩葉片。將直徑5 mm左右的葉片置于50 μL Buffer P1中,用槍頭將葉片搗碎,搗碎后溶液呈現(xiàn)綠色,瞬時(shí)離心,上清液請(qǐng)放在4℃?zhèn)溆茫? μL用于PCR擴(kuò)增。

            2)加熱裂解法:推薦使用幼嫩葉片。將直徑5 mm左右的葉片置于50 μL Buffer P1中,95℃加熱5-10 min(確保裂解液完全浸沒(méi)葉片),較難裂解的葉片(老葉片)可適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間(10-20 min),加熱裂解后溶液呈現(xiàn)綠色,震蕩混勻,瞬時(shí)離心,上清液請(qǐng)放在4℃?zhèn)溆茫? μL用于PCR擴(kuò)增。

            3)直接法:推薦使用幼嫩葉片。使用打孔器或者刀,將直徑1 mm左右的葉片直接加入到PCR反應(yīng)體系中;復(fù)雜樣本或者是長(zhǎng)片段的擴(kuò)增,推薦使用直徑<1 mm的葉片。

            2.PCR反應(yīng)體系

            組分

            體積(μL)

            體積(μL)

            終濃度

            2× Plant Master Mix

            10

            25

            Forward Primer (10 μM)

            0.5

            1

            0.2-0.25 μM

            Reverse Primer (10 μM)

            0.5

            1

            0.2-0.25 μM

            裂解產(chǎn)物(DNA模板)

            1

            2

            -

            ddH2O

            To 20

            To 50

            -

            1 反應(yīng)體系

            *各組分使用前應(yīng)充分混勻。

            1)模板加入量:小于PCR反應(yīng)體系的5%,過(guò)多會(huì)嚴(yán)重抑制PCR反應(yīng),強(qiáng)烈推薦加入1 μL模板。葉片直擴(kuò)優(yōu)先推薦研磨儀裂解法。

            2)引物終濃度:0.2-0.25 μM可以得到較好結(jié)果。反應(yīng)性能較差時(shí),可在0.1-0.5 μM范圍內(nèi)調(diào)整引物濃度。

            3)反應(yīng)體系:推薦使用20 μL或50 μL,以保證目的基因擴(kuò)增的有效性和重復(fù)性。

            4)體系配制:配制好PCR反應(yīng)體系,置于渦旋儀上渦旋混勻,瞬時(shí)離心將反應(yīng)液集于管底。

            5)對(duì)照反應(yīng):建議進(jìn)行PCR時(shí),設(shè)置陽(yáng)性和陰性PCR對(duì)照反應(yīng)以便于排除假陽(yáng)性或假陰性的干擾。

            6)為了更穩(wěn)定的保存裂解后的模板,將轉(zhuǎn)移出來(lái)的上清液,按照裂解產(chǎn)物(DNA模板):Buffer P2 = 5:1的比例混合,混勻后-20℃保存,穩(wěn)定保存隨時(shí)間和樣本狀態(tài)不同而有所不同。如果處理后的植物葉片上清液一周內(nèi)用于PCR擴(kuò)增,不用加Buffer P2,上清液請(qǐng)保存在-20℃。

            3.反應(yīng)條件

            循環(huán)步驟

            溫度°C

            時(shí)間

            循環(huán)數(shù)

            預(yù)變性

            94

            5 min

            1

            變性

            94

            10 sec

            35

            退火*

            50-65

            20 sec

            延伸**

            72

            1 min/kb

            終延伸

            72

            5 min

            1

            2 反應(yīng)條件

            *退火溫度:請(qǐng)參考引物的理論 Tm 值,退火溫度可設(shè)置低于引物理論值 2-5℃。

            **延伸時(shí)間:需要根據(jù)片段的長(zhǎng)度來(lái)確定,對(duì)于1 kb以內(nèi)的DNA片段,建議延長(zhǎng)時(shí)間為1 min。

             

             

            注意事項(xiàng)

             

            1. 做葉片實(shí)驗(yàn)時(shí),建議使用新鮮采取的葉片組織,若為長(zhǎng)期冷凍組織,需-80℃保存,應(yīng)盡量避免反復(fù)凍融,以免造成模板降解,影響PCR效率。葉片組織以幼嫩為宜,若為成熟的葉片,避免使用葉片主脈部位組織。
            2. 建議擴(kuò)增片段長(zhǎng)度1 kb以內(nèi),以便擴(kuò)增效率最佳。
            3. 取樣時(shí)使用打孔器或者刀取適宜大小的樣本,樣本不同時(shí),打孔器或者刀每次處理樣本前需清洗干凈。
            4. 對(duì)于葉片組織,建議取1-10 mm的葉片,過(guò)小會(huì)使PCR擴(kuò)增產(chǎn)量低,過(guò)多會(huì)抑制PCR反應(yīng),采用加熱裂解法、槍頭搗碎、研磨儀破碎的方式處理植物葉片,處理后需震蕩離心,務(wù)必取上清液試驗(yàn),沉淀會(huì)嚴(yán)重抑制PCR反應(yīng)。
            5. 為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
            6. 本產(chǎn)品僅作科研用途!

             

            常見(jiàn)問(wèn)題與解決方法

             

            常見(jiàn)問(wèn)題

            可能原因

            解決方法

            陽(yáng)性對(duì)照、待測(cè)樣本均無(wú)條帶。

            PCR反應(yīng)體系或反應(yīng)條件不合適。

            使用梯度PCR摸索PCR最佳反應(yīng)條件。

            PCR試劑保存不當(dāng)失去活性。

            2×PCR Mix應(yīng)保存于-25~-15℃,使用時(shí)避免反復(fù)凍融。若使用頻繁,可在2-8℃短時(shí)間存放。

            引物設(shè)計(jì)問(wèn)題。

            嘗試重新設(shè)計(jì)引物進(jìn)行檢查。

            陽(yáng)性對(duì)照有目的條帶,待測(cè)樣本無(wú)條帶或條帶弱。

            不當(dāng)儲(chǔ)存或長(zhǎng)期儲(chǔ)存引起試劑活性喪失。

            使用新鮮的試劑。

            裂解液、中和液加入比例不當(dāng),裂解混合液影響PCR體系的pH值。

            正常條件下,中和后的裂解混合液的pH應(yīng)該在7-8左右裂解產(chǎn)物和Buffer P2嚴(yán)格按照5:1的量進(jìn)行中和。

            樣本裂解混合液保存不當(dāng)或保存時(shí)間過(guò)久,DNA基因組已經(jīng)降解。

            裂解混合液可在2-8℃保存5天,盡量使用新制備的裂解液混合液進(jìn)行PCR。

            模板加入量不適合。

            在反應(yīng)體系<5%范圍內(nèi)優(yōu)化模板加入量。

            PCR循環(huán)數(shù)不足。

            適當(dāng)增加PCR的循環(huán)數(shù),推薦在35-40循環(huán)為佳。因?yàn)槟0鍙?fù)雜,一般PCR反應(yīng)要比用純化的DNA模板多5-10個(gè)循環(huán)為佳。

            非特異性擴(kuò)增

            PCR退火溫度太低,循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度太高。

            提高PCR退火溫度,降低PCR循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度。

            PCR引物錯(cuò)配。

            重新設(shè)計(jì)PCR引物。

            配制PCR反應(yīng)體系時(shí)溫度太高或配制完成后放置時(shí)間太久。

            PCR反應(yīng)體系的配制在低溫下進(jìn)行,配制完成后盡快進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。

            陰性對(duì)照出現(xiàn)目的條帶

            操作工具或試劑污染。

            實(shí)驗(yàn)所有試劑或器材均應(yīng)高壓滅菌。操作時(shí)應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或?yàn)R出離心管外。

            樣本間交叉污染。

            每個(gè)取樣器只對(duì)一個(gè)樣本使用;或取完一個(gè)樣本后,將取樣器刃口浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復(fù)涮洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液。

             

             

             

            Ver.CN20250304

             

             

             

            400-6111-883