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            翌圣ZymeEditor平臺(tái)RPA核心酶原料助力恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)升級(jí)!

            重組酶聚合酶擴(kuò)增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA)是Piepenburg等人在2006年利用參與細(xì)胞DNA合成的蛋白重組和修復(fù)開發(fā)出的一種新的核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。該技術(shù)可以在37~42 ℃條件下實(shí)現(xiàn)待測(cè)靶標(biāo)的快速檢測(cè)。它具有反應(yīng)靈敏度高、特異性強(qiáng)、對(duì)儀器依賴程度低且可整合多種檢測(cè)模式等優(yōu)點(diǎn),特別適用于基層和現(xiàn)場(chǎng)即時(shí)檢測(cè),可廣泛應(yīng)用于體外診斷、獸醫(yī)、食品安全、生物安全、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域[1]。

             

            一、RPA技術(shù)原理

            RPA技術(shù)主要依賴于能結(jié)合寡核苷酸引物的T4噬菌體來源的重組酶T4 UvsX、單鏈結(jié)合蛋白gp32和鏈置換Bsu DNA 聚合酶以及兩條特異性的上下游引物實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增,具體擴(kuò)增原理如圖1所示:

            1.重組酶聚合酶擴(kuò)增RPA技術(shù)擴(kuò)增原理圖[2]

            1.重組酶引物復(fù)合體的形成:重組酶T4 UvsX在ATP的參與和定位因子(T4 UvsY)的幫助下與擴(kuò)增引物結(jié)合形成重組酶引物復(fù)合體,并在雙鏈DNA中尋找同源序列;

            2.重組酶引物復(fù)合體定位至同源序列:重組酶引物復(fù)合體一旦定位到同源序列,則會(huì)插入雙鏈DNA形成D-環(huán)結(jié)構(gòu),啟動(dòng)鏈置換反應(yīng),單鏈結(jié)合蛋白gp32會(huì)與解開的DNA鏈結(jié)合防止進(jìn)一步被置換。

            3.鏈置換擴(kuò)增啟動(dòng):重組酶T4 UvsX從重組酶引物復(fù)合體中被水解,3'端引物暴露并與Bsu DNA聚合酶結(jié)合,DNA開始復(fù)制延伸,最終兩條母鏈分離,形成兩條新的互補(bǔ)雙鏈DNA。該反應(yīng)在37-42℃下進(jìn)行,可在30 min內(nèi)實(shí)現(xiàn)目標(biāo)序列1012倍的擴(kuò)增。

             

            二、RPA技術(shù)優(yōu)勢(shì)
            1. 檢測(cè)靈敏度高:可將痕量的核酸模板(低至單拷貝)擴(kuò)增至可以檢出的水平,且通常無需進(jìn)行核酸純化。
            2. 無需昂貴的配套儀器設(shè)備:37~42°C恒溫反應(yīng),無須熱循環(huán),擺脫儀器束縛,方便快捷。
            3. 樣本耐受性高:適合復(fù)雜樣本的擴(kuò)增檢測(cè)。例如未經(jīng)核酸純化的血液或鼻拭子,只需要通過熱或堿進(jìn)行預(yù)處理促進(jìn)核酸釋放即可。
            4. 檢測(cè)方法多樣化:包括電泳法檢測(cè)、熒光探針法檢測(cè)、側(cè)流層析試紙條檢測(cè)等。

             

            三、RPA技術(shù)應(yīng)用
            RPA技術(shù)可用于不同種類的目標(biāo)生物檢測(cè),如細(xì)菌、真菌、病毒、原生動(dòng)物等的雙鏈DNA、單鏈DNA、甲基化DNA以及通過RNA或miRNA反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的cDNA等核酸樣本。RPA技術(shù)目前已被成功應(yīng)用于農(nóng)業(yè)、醫(yī)學(xué)、食品、疫病防控等領(lǐng)域,具有廣闊的應(yīng)用前景。

             

            圖2.RPA技術(shù)應(yīng)用

             

            四、RPA技術(shù)核心酶原料
            翌圣ZymeEditor™酶改造平臺(tái)針對(duì)RPA技術(shù),目前已獲得RPA全系列性能優(yōu)良的產(chǎn)品,包括鏈置換Bsu DNA polymerase、T4 UvsX Recombinase、T4 UvsY protein、T4 gene 32 protein、肌酸激酶Creatine Kinase和Exonuclease III。

             

            翌圣RPA產(chǎn)品選擇指南

             

            產(chǎn)品名稱 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品作用
            Bsu DNA polymerase (Large fragment, 5 U/μL) 11078ES 結(jié)合引物與原始靶核酸序列互補(bǔ)合成新的DNA模板
            T4 UvsX Recombinase (2 μg/μL) 11079ES 具有配對(duì)和鏈轉(zhuǎn)移活性的重組酶
            T4 UvsY protein (2 μg/μL) 11080ES 重組酶輔助因子,刺激T4 UvsX的單鏈DNA依賴性ATP酶活性并降低活性所需的T4 UvsX臨界濃度
            T4 gene 32 protein (gp 32) T4噬菌體基因32編碼蛋白 11081ES 參與DNA復(fù)制、修復(fù)、重組與解鏈后的單鏈DNA結(jié)合,防止自雜交
            Creatine Kinase (2 μg/μL) 肌酸激酶 14502ES 刺激ATP和肌酸分解為磷酸肌酸和ADP,釋放能量
            Exonuclease III (100 U/μL) 14525ES 具有3’→5’外切酶活性,切斷熒光探針中淬滅基團(tuán),釋放熒光

             

            客戶測(cè)試案例展示

             

            客戶采用翌圣Bsu DNA polymerase (Large fragment, 5 U/μL)、T4 UvsX Recombinase (2 μg/μL)、T4 UvsY protein (2 μg/μL)、T4 gene 32 protein (gp 32)、肌酸激酶Creatine Kinase (2 μg/μL) 進(jìn)行RPA擴(kuò)增反應(yīng),得到正確的目的條帶,且條帶清晰、明亮,結(jié)果表明,PRA技術(shù)核心酶原料可實(shí)現(xiàn)高效RPA等溫?cái)U(kuò)增。

            圖3 客戶測(cè)試翌圣重組酶聚合酶核心酶原料擴(kuò)增結(jié)果圖

            注:2、4為陽(yáng)性實(shí)驗(yàn)組;1、3為陰性對(duì)照組

             

            參考文獻(xiàn)

            [1] Zhao Y, Chen F, Li Q, Wang L, Fan C. Isothermal Amplification of Nucleic Acids. Chem Rev. 2015 Nov 25;115(22):12491-545. doi: 10.1021/acs.chemrev.5b00428. Epub 2015 Nov 9. PMID: 26551336.

            [2] 王亞楠, 陳昌國(guó). 重組酶聚合酶擴(kuò)增技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志, 2021, 46(5):8.

             

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